カギの交換代を退去時に請求されました。

鍵交換代については、鍵交換費用負担特約等を設けている場合に限って借主負担にできると解されます（参考、東京地判平成21年9月18日）。そして今回のケースでは「退去時にも払う」旨の記載はないとのことですので、支払う必要はないものと考えます。
ただし、入居中に鍵を紛失して交換する必要が生じたなど特段の事情がある場合には原状回復の一部として費用が発生する可能性はあります。どういった根拠に基づいて請求しているのかを先方に確認し、その上で対応を決められるのが賢明かと存じます。